Chromatin Regulator | Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CBX3 | HECH;HP1-GAMMA; | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Related histone modifications: | H3K9me1;H3K9me2;H3K9me3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Introduction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Full name: Chromobox protein homolog 3. Cbx3 is a member of the family of heterochromatin protein 1 (HP1) proteins,which is a family of highly conserved heterochromatin-associated non-histone chromosomal proteins and has been reported to specifically recognize methylated histone H3K9 mark.Cbx3 contains an N-terminal chromodomain (CHD) and a C-terminal dimerization chromo shadow domain (CSD) separated by a poorly conserved hinge region(1-3). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function and Interaction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cbx3 is a paralogue of heterochromatin protein 1 (HP1) proteins,posseses two conserved domains,the N-terminal chromodomain (CHD) which selectively recognizes methylated histone H3K9 mark,and the chromoshadow domain (CSD) through which HP1 forms dimers with other HP1 molecules or with other proteins and regulates the binding activity of the CHD(4-5).Cbx3 is involved in silencing at E2F- and MYC-responsive genes in G0 cells(6).Cbx3 is required for the repression of the progestin responsive MMTV promoter in breast cancer cells(7).In conjunction with SUV39H1,Cbx3 is also responsible for chromatin-mediated repression of the HIV-1 gene(8). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Association | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChIP-Seq data
ChIP-Seq data of related histone modifications
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References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1.Eissenberg, J.C., and Elgin, S.C. (2000). The HP1 protein family: getting a grip on chromatin. Curr Opin Genet Dev 10, 204-210. 2.Nielsen, A.L., Oulad-Abdelghani, M., Ortiz, J.A., Remboutsika, E., Chambon, P., and Losson, R. (2001). Heterochromatin formation in mammalian cells: interaction between histones and HP1 proteins. Mol Cell 7, 729-739. 3.Ruan, J., Ouyang, H., Amaya, M.F., Ravichandran, M., Loppnau, P., Min, J., and Zang, J. (2012). Structural basis of the chromodomain of Cbx3 bound to methylated peptides from histone h1 and G9a. PLoS One 7, e35376. 4.Mishima, Y., Jayasinghe, C.D., Lu, K., Otani, J., Shirakawa, M., Kawakami, T., Kimura, H., Hojo, H., Carlton, P., Tajima, S., et al. (2015). Nucleosome compaction facilitates HP1gamma binding to methylated H3K9. Nucleic Acids Res 43, 10200-10212. 5.Lomberk, G., Wallrath, L., and Urrutia, R. (2006). The Heterochromatin Protein 1 family. Genome Biol 7, 228. 6.Ogawa, H., Ishiguro, K., Gaubatz, S., Livingston, D.M., and Nakatani, Y. (2002). A complex with chromatin modifiers that occupies E2F- and Myc-responsive genes in G0 cells. Science 296, 1132-1136. 7.Vicent, G.P., Ballare, C., Nacht, A.S., Clausell, J., Subtil-Rodriguez, A., Quiles, I., Jordan, A., and Beato, M. (2006). Induction of progesterone target genes requires activation of Erk and Msk kinases and phosphorylation of histone H3. Mol Cell 24, 367-381. 8.du Chene, I., Basyuk, E., Lin, Y.L., Triboulet, R., Knezevich, A., Chable-Bessia, C., Mettling, C., Baillat, V., Reynes, J., Corbeau, P., et al. (2007). Suv39H1 and HP1gamma are responsible for chromatin-mediated HIV-1 transcriptional silencing and post-integration latency. EMBO J 26, 424-435. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Figure Gallery
About Chromatin Regulator
Chromatin Regulator Cistrome
is a unique database integrating curated information of CRs, CR ChIP-seq datasets, CR related HM ChIP-seq datasets, and analysis of the relationship between CRs and HMs ChIP-seq pairs in human and mouse.