Chromatin Regulator | Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KDM4B | JMJD2B,TDRD148,KIAA0876,JHDM3B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: | Wiki GeneCards NCBI UniProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Related histone modifications: | H3K9me3;H3K36me3;H3K36me2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Introduction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Full name:Lysine (K)-specific demethylase 4B. KDM4B is a demethylase that specifically demethylates tri-methylation on histone H3K9(H3K9me3) and is reported to activate gene transcription through regulation of chromatin structure,plays a special roles in colorectal cancer(CRC),prostate cancer,gastric cancer and pancreatic cancer,is required for expression of the ER and FOXA1 genes,involving in process like development,transcriptional regulation,cell apoptosis,cell proliferation and suppression of senescence(1,2,3,4,5,7,8,10). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function and Interaction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KDM4B/JMJD2B was found as a direct target of hypoxia-inducible factor 1α (HIF1α) and regulated by HIF1α and estrogen receptor α (ERα) in breast cancer and promoted hormonally responsive breast carcinogenesis(1,2,3,5).KDM4B is overexpressed in colorectal cancer and is significant for the mediation of mitochondrial apoptosis in colorectal cells(2).KDM4B interacts with the transcription factor GATA-3 in BCa cell lines and directly co-activates GATA-3 activity(4).KDM4B could regulate multiple pathways which contribute to carcinogenesis,including the cell-cycle pathway(6).KDM4B silencing promotes cell apoptosis,plays an essential role in mitochondrial apoptosis by targeting HAX1(2).KDM4B is a positive regulator of EMT process promoting epithelial-mesenchymal transition through epigenetic regulation of ZEB1 in pancreatic cancer(7).KDM4B/JMJD2B is found to be necessary for self-renewal of embryonic stem cells and induced pluripotent stem cell generation(9). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Association | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KDM4B is shown to be overexpressed in clinical colorectal cancers and regulates cell apoptosis，it also promote growth in bladder cancer,lung cancer and gastric cancer(1,2,7),and KDM4B promotes epithelial-mesenchymal transition through up-regulation of ZEB1 in pancreatic cancer(7). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChIP-Seq data
ChIP-Seq data of related histone modifications
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References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1.Wenjuan Li,Li Zhao,Wen Zang,Zhifang Liu,Long Chen,Tiantian Liu,Dawei Liu,Jihui Jia. (2011). Histone demethylase JMJD2B is required for tumor cell proliferation and survival and is overexpressed in gastric cancer. Biochem Biophys Res Commun. 416(3-4): 372-378. 2.Haijie Li,Xi Yang,Guihua Wang,Xiaolan Li,Deding Tao,Junbo Hu,Xuelai Luo. (2016). KDM4B plays an important role in mitochondrial apoptosis by upregulating HAX1 expression in colorectal cancer. Oncotarget. 57866-57876. 3.Shi L,Sun L,Li Q,Liang J,Yu W,Yi X,Yang X,Li Y, Han X, Zhang Y, Xuan C, Yao Z, Shang Y. (2011).Histone demethylase JMJD2B coordinates H3K4/H3K9 methylation and promotes hormonally responsive breast carcinogenesis. Proc Natl Acad Sci USA. 108:7541–7546. 4.Gaughan L, Stockley J, Coffey K, O’Neill D, Jones DL, Wade M, Wright J, Moore M, Tse S, Rogerson L, Robson CN. (2012). KDM4B is a master regulator of the estrogen receptor signalling cascade. Nucleic Acids Res. 41:6892–6904. 5.Pfau R,Tzatsos A,Kampranis SC,Serebrennikova OB, Bear SE,and Tsichlis PN.(2008). Members of a family of JmjC domain-containing oncoproteins immortalize embryonic fibroblasts via a JmjC domain-dependent process. Proc Natl Acad Sci U S A. 105(6):1907-1912. 6.Toyokawa G, Cho HS, Iwai Y, Yoshimatsu M, Takawa M, Hayami S, Maejima K, Shimizu N, Tanaka H, Tsunoda T, Field HI, Kelly JD, Neal DE, et al. (2011). The histone demethylase JMJD2B plays an essential role in human carcinogenesis through positive regulation of cyclin-dependent kinase 6. Cancer Prev Res (Phila). 4:2051–2061. 7.Shuo Li,Linlin Wu,Qingbing Wang,Yingyi Li and Xiaolin Wang.(2015). KDM4B promotes epithelial-mesenchymal transition through up-regulation of ZEB1 in pancreatic cancer. Acta Biochim Biophys Sin (Shanghai). 47(12):997-1004. 8.Fujiwara K,Fujita Y,Kasai A,Onaka Y,Hashimoto H,Okada H,Yamashita T.(2016). Deletion of JMJD2B in neurons leads to defective spine maturation, hyperactive behavior and memory deficits in mouse. Translational Psychiatry. 6,e766. 9.Das PP, Shao Z, Beyaz S, Apostolou E, Pinello L, De Los Angeles A et al. (2014). Distinct and combinatorial functions of Jmjd2b/Kdm4b and Jmjd2c/Kdm4c in mouse embryonic stem cell identity. Mol Cell. 53:32–48. 10.Whetstine, J.R., Nottke, A., Lan, F., Huarte, M., Smolikov, S., Chen, Z., Spooner, E., Li, E., Zhang, G., Colaiacovo, M., et al. (2006). Reversal of histone lysine trimethylation by the JMJD2 family of histone demethylases. Cell 125, 467-481. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Figure Gallery
About Chromatin Regulator
Chromatin Regulator Cistrome
is a unique database integrating curated information of CRs, CR ChIP-seq datasets, CR related HM ChIP-seq datasets, and analysis of the relationship between CRs and HMs ChIP-seq pairs in human and mouse.