Chromatin Regulator | Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KDM4C | GASC1;JHDM3C;JMJD2C;TDRD14C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Related histone modifications: | H3K9me2;H3K9me3;H3K36me2;H3K36me3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Introduction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Full name: Lysine (K)-specific demethylase 4C. KDM4C is a member of the Jumonji domain 2 (JMJD2) family,is amplified and overexpressed in esophageal squamous carcinomas,colon cancer,prostate cancer,basal-like breast cancer(3,4,5,6,8,11),demethylates H3K9me3/me2 and H3K36me3/me2 through a hydroxylation reaction requiring iron and α-ketoglutarate as cofactors(1,9,10),involing in process like development,differentiation,cell growth,transcriptional regulation,chromosome segregation and carcinogenesis(2,5,6,7,8). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function and Interaction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KDM4C induced demethylation at histone H3K9 to activate VE-cadherin expression and thus enabled the differentiation of mESCs to endothelial cells(2).KDM4C forms complexes with β-catenin,an oncoprotein whose overexpression is crucial for the development of most colonic tumors,KDM4C is required for efficient expression of the growth stimulatory proteins FRA1 and cyclin D1 as well as the survival factor BCL2(4).KDM4C and LSD1 interact and both demethylases cooperatively stimulate androgen receptor-dependent gene transcription,KDM4C,androgen receptor and LSD1 assemble on chromatin to remove methyl groups from mono, di and trimethylated H3K9(5).KDM4C demethylase activity regulates the expression of genes critical for stem cell self-renewal,including NOTCH1,is a driving oncogene in the 9p23-24 amplicon in human breast cancer[6].KDM4C associates with mitotic chromatin through Tudor domains and dysregulation of KDM4C demethylase activity promotes chromosome instability(CIN) by impairing the fidelity of mitotic chromosome segregation(8).KDM4C is targeted to H3K4me3-positive transcription start sites,where it can contribute to transcriptional regulation(9). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Association | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KDM4C is a crucial oncogene amplififed and overexpressed in esophageal squamous carcinomas,colon cancer,prostate cancer and basal-like breast cancer(3,4,5,6,8). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChIP-Seq data
ChIP-Seq data of related histone modifications
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References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1.Cloos, P.A., Christensen, J., Agger, K., Maiolica, A., Rappsilber, J., Antal, T., Hansen, K.H., and Helin, K. (2006). The putative oncogene GASC1 demethylates tri- and dimethylated lysine 9 on histone H3. Nature 442, 307-311. 2.Wu, L., Wary, K.K., Revskoy, S., Gao, X., Tsang, K., Komarova, Y.A., Rehman, J., and Malik, A.B. (2015). Histone Demethylases KDM4A and KDM4C Regulate Differentiation of Embryonic Stem Cells to Endothelial Cells. Stem Cell Reports 5, 10-21. 3.Garcia, J., and Lizcano, F. (2016). KDM4C Activity Modulates Cell Proliferation and Chromosome Segregation in Triple-Negative Breast Cancer. Breast Cancer (Auckl) 10, 169-175. 4.Kim, T.D., Fuchs, J.R., Schwartz, E., Abdelhamid, D., Etter, J., Berry, W.L., Li, C., Ihnat, M.A., Li, P.K., and Janknecht, R. (2014). Pro-growth role of the JMJD2C histone demethylase in HCT-116 colon cancer cells and identification of curcuminoids as JMJD2 inhibitors. Am J Transl Res 6, 236-247. 5.Wissmann, M., Yin, N., Muller, J.M., Greschik, H., Fodor, B.D., Jenuwein, T., Vogler, C., Schneider, R., Gunther, T., Buettner, R., et al. (2007). Cooperative demethylation by JMJD2C and LSD1 promotes androgen receptor-dependent gene expression. Nat Cell Biol 9, 347-353. 6.Liu, G., Bollig-Fischer, A., Kreike, B., van de Vijver, M.J., Abrams, J., Ethier, S.P., and Yang, Z.Q. (2009). Genomic amplification and oncogenic properties of the GASC1 histone demethylase gene in breast cancer. Oncogene 28, 4491-4500. 7.Pedersen, M.T., Kooistra, S.M., Radzisheuskaya, A., Laugesen, A., Johansen, J.V., Hayward, D.G., Nilsson, J., Agger, K., and Helin, K. (2016). Continual removal of H3K9 promoter methylation by Jmjd2 demethylases is vital for ESC self-renewal and early development. EMBO J 35, 1550-1564. 8.Kupershmit, I., Khoury-Haddad, H., Awwad, S.W., Guttmann-Raviv, N., and Ayoub, N. (2014). KDM4C (GASC1) lysine demethylase is associated with mitotic chromatin and regulates chromosome segregation during mitosis. Nucleic Acids Res 42, 6168-6182. 9.Pedersen, M.T., Agger, K., Laugesen, A., Johansen, J.V., Cloos, P.A., Christensen, J., and Helin, K. (2014). The demethylase JMJD2C localizes to H3K4me3-positive transcription start sites and is dispensable for embryonic development. Mol Cell Biol 34, 1031-1045. 10.Whetstine, J.R., Nottke, A., Lan, F., Huarte, M., Smolikov, S., Chen, Z., Spooner, E., Li, E., Zhang, G., Colaiacovo, M., et al. (2006). Reversal of histone lysine trimethylation by the JMJD2 family of histone demethylases. Cell 125, 467-481. 11.Yang, Z.Q., Imoto, I., Fukuda, Y., Pimkhaokham, A., Shimada, Y., Imamura, M., Sugano, S., Nakamura, Y., and Inazawa, J. (2000). Identification of a novel gene, GASC1, within an amplicon at 9p23-24 frequently detected in esophageal cancer cell lines. Cancer Res 60, 4735-4739. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Figure Gallery
About Chromatin Regulator
Chromatin Regulator Cistrome
is a unique database integrating curated information of CRs, CR ChIP-seq datasets, CR related HM ChIP-seq datasets, and analysis of the relationship between CRs and HMs ChIP-seq pairs in human and mouse.