Chromatin Regulator | Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CBX7 | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: | Wiki GeneCards NCBI UniProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Related histone modifications: | H3K27me3;H3K9me3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Introduction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Full name: Chromobox protein homolog 7 CBX7 is a homolog of Polycomb proteins,contains a chromodomain which is capable of recognizing repressive marks such as trimethylated Lys-9 and Lys-27,respectively,on histone H3(1).CBX7 is a component of Polycomb repressive complex 1 (PRC1),a key regulator of developmental genes.CBX7 chromodomain also binds to trimethylated SETDB1 peptides with equal or greater affinity than histone peptides and don't bind to the non-methylated pepetides,suggests that CBX7 are likely to have an alternative non-histone binding activity(2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function and Interaction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CBX7 is the predominant PRC1-associated CBX subunit in proliferating ESCs and requires the H3K27me3 marks to localize to chromatin and thereby silence the expression of lineage commitment genes(3).CBX7 extends the lifespan of a wide range of normal human cells and immortalizes mouse fibroblasts by downregulating expression of the Ink4a/Arf locus and can function independently of BMI-1(4-5).CBX7 can inititate T cell lymphomagenesis and cooperate with c-Myc to produce highly aggressive B cell lymphomas(6). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Association | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CBX7 is up-regulated in follicular lymphoma and possesses oncogenic properties in the hematopoietic compartment(6). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChIP-Seq data
ChIP-Seq data of related histone modifications
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References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1.Fischle, W., Wang, Y., Jacobs, S.A., Kim, Y., Allis, C.D., and Khorasanizadeh, S. (2003). Molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine marks in histone H3 by Polycomb and HP1 chromodomains. Genes Dev 17, 1870-1881. 2.Kaustov, L., Ouyang, H., Amaya, M., Lemak, A., Nady, N., Duan, S., Wasney, G.A., Li, Z., Vedadi, M., Schapira, M., et al. (2011). Recognition and specificity determinants of the human cbx chromodomains. J Biol Chem 286, 521-529. 3.Morey, L., Aloia, L., Cozzuto, L., Benitah, S.A., and Di Croce, L. (2013). RYBP and Cbx7 define specific biological functions of polycomb complexes in mouse embryonic stem cells. Cell Rep 3, 60-69. 4.Gil, J., Bernard, D., Martinez, D., and Beach, D. (2004). Polycomb CBX7 has a unifying role in cellular lifespan. Nat Cell Biol 6, 67-72. 5.Maertens, G.N., El Messaoudi-Aubert, S., Racek, T., Stock, J.K., Nicholls, J., Rodriguez-Niedenfuhr, M., Gil, J., and Peters, G. (2009). Several distinct polycomb complexes regulate and co-localize on the INK4a tumor suppressor locus. PLoS One 4, e6380. 6.Scott, C.L., Gil, J., Hernando, E., Teruya-Feldstein, J., Narita, M., Martinez, D., Visakorpi, T., Mu, D., Cordon-Cardo, C., Peters, G., et al. (2007). Role of the chromobox protein CBX7 in lymphomagenesis. Proc Natl Acad Sci U S A 104, 5389-5394. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Figure Gallery
About Chromatin Regulator
Chromatin Regulator Cistrome
is a unique database integrating curated information of CRs, CR ChIP-seq datasets, CR related HM ChIP-seq datasets, and analysis of the relationship between CRs and HMs ChIP-seq pairs in human and mouse.