Chromatin Regulator | Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DPY30 | HDPY-30;Cps25;Saf19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: | Wiki GeneCards NCBI UniProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Related histone modifications: | H3K4me1;H3K4me2;H3K4me3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Introduction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Full name: Dpy-30,Histone Methyltransferase Complex Subunit. DPY-30 was discovered as an essential component of the C.elegans dosage compensation machinery that reduces X chromosome transcript levels in hermaphrodites(XX) and play important roles in worm development and behavior(1-2),binds directly with ASH2L and is a common subunit of all the MLL complexes which is involved in the methylation of histone H3 at Lys-4(3-4),is implicated in the endosomal transport of specific cargo proteins(5). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function and Interaction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DPY-30 is a core subunit of the SET1/MLL histone methyltransferase complexes,modulates H3K4 methylation in vitro, and directly regulates chromosomal H3K4 trimethylation (H3K4me3) throughout the mammalian genome(3,6).DPY-30 and SET1/MLL complex-mediated H3K4 methylation,as a component of the bivalent mark,at developmental genes during the ESC fate transitions(3).DPY-30 is a ubiquitous factor that is likely to promote the hermaphrodite-specific association of DPY-27 with X by affecting the activity of a sex-specific dosage compensation gene(2).DPY-30 is required for normal motility, organizing duplicated subunits in the radial spoke stalk and formation of a symmetrical spokehead(7). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Association | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChIP-Seq data
ChIP-Seq data of related histone modifications
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References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1.Hsu, D.R., and Meyer, B.J. (1994). The dpy-30 gene encodes an essential component of the Caenorhabditis elegans dosage compensation machinery. Genetics 137, 999-1018. 2.Hsu, D.R., Chuang, P.T., and Meyer, B.J. (1995). DPY-30, a nuclear protein essential early in embryogenesis for Caenorhabditis elegans dosage compensation. Development 121, 3323-3334. 3.Jiang, H., Shukla, A., Wang, X., Chen, W.Y., Bernstein, B.E., and Roeder, R.G. (2011). Role for Dpy-30 in ES cell-fate specification by regulation of H3K4 methylation within bivalent domains. Cell 144, 513-525. 4.Cho, Y.W., Hong, T., Hong, S., Guo, H., Yu, H., Kim, D., Guszczynski, T., Dressler, G.R., Copeland, T.D., Kalkum, M., et al. (2007). PTIP associates with MLL3- and MLL4-containing histone H3 lysine 4 methyltransferase complex. J Biol Chem 282, 20395-20406. 5.Xu, Z., Gong, Q., Xia, B., Groves, B., Zimmermann, M., Mugler, C., Mu, D., Matsumoto, B., Seaman, M., and Ma, D. (2009). A role of histone H3 lysine 4 methyltransferase components in endosomal trafficking. J Cell Biol 186, 343-353. 6.Patel, A., Dharmarajan, V., Vought, V.E., and Cosgrove, M.S. (2009). On the mechanism of multiple lysine methylation by the human mixed lineage leukemia protein-1 (MLL1) core complex. J Biol Chem 284, 24242-24256. 7.Gopal, R., Foster, K.W., and Yang, P. (2012). The DPY-30 domain and its flanking sequence mediate the assembly and modulation of flagellar radial spoke complexes. Mol Cell Biol 32, 4012-4024. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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About Chromatin Regulator
Chromatin Regulator Cistrome
is a unique database integrating curated information of CRs, CR ChIP-seq datasets, CR related HM ChIP-seq datasets, and analysis of the relationship between CRs and HMs ChIP-seq pairs in human and mouse.